Le Haut-Rhin était autrefois appelé la Haute-Alsace. elle faisait partie du du diocèse de Baie (sauf quelques communes du nord rattachées au diocèse de Strasbourg et d'autres, situées au sud, rattachées au diocèse de Besançon)
Ses frontières ont évolué avec le temps. Au fil de l'histoire, ce département détenait des communes situées dans le Jura Suisse, du Doubs et l'actuel Territoire de Belfort.
Les villes de Mulhouse et d'Illzach sont un cas particulier. En effet, l'état-civil ne fait son apparition en 1798, lors du rattachement de ces 2 communes au royaume de France. Précédemment, elles étaient des enclaves helvétiques.
Durant la Révolution, certains noms de communes ont été modifiés, pour exemple :
Nom Révolutionnaire Nom original
Bourg-Libre Saint-Louis
Mont-Libre Kaysersberg
Les noms étant jugés trop cléricale ou seigneuriale.
Depuis, ces communes ont retrouvé, leur nom d'origine.
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